O campeonato Paulista de 2006 foi disputado por 20 clubes, no sistema de pontos corridos, em turno único. O Verdão largou forte, vencendo as primeiras cinco partidas contra equipes do interior. A invencibilidade caiu no primeiro clássico, contra o SPFC.
O Palmeiras disputou com o Santos e com o SPFC a ponta da tabela durante quase todo o campeonato, mas acabou ficando para trás na reta final. Na rodada 16, o time empatou o Derby e ficou a quatro pontos do Santos.
Já dependendo de resultados, o Verdão acabou eliminado na rodada 17, ao perder por 3 a 0 em Jundiaí para o Paulista, enquanto o Santos vencia seu jogo e abria sete pontos.
As duas rodadas finais foram amistosos melancólicos; o Palmeiras perdeu do Rio Branco para menos de 1400 pagantes no Palestra e fechou a conta vencendo o Santo André no ABC para pouco mais de 2 mil pessoas.
